Em Doom 3 BFG Edition, o jogador assume o controle de um fuzileiro enviado à Marte para uma missão de mineração. Lá, a expedição descobre ruínas indicando que os marcianos conseguiram desenvolver um teletransporte. Infelizmente, os presentes descobrem tarde demais que o destino alcançado é o inferno, e a estação é tomada por demônios e criaturas malignas.
A edição especial traz gráficos refinados em 3D, novas mecânicas de jogo, a expansão Resurrection of Evil e sete novas missões intergradas ao game. Como uma forma de agradar a todos os fãs da série, a id Software incluiu no pacote de extras os dois primeiros títulos da franquia na integra.